代謝組學(xué)是指細胞、組織、器官或者生物體內(nèi)的所有小分子代謝組分（主要是相對分子量1000以內(nèi)的內(nèi)源性小分子）的集合。代謝組學(xué)分為靶向代謝組學(xué)和非靶向代謝組學(xué)。

　　

　　新陳代謝網(wǎng)絡(luò)是十分復(fù)雜的網(wǎng)絡(luò)，而人體的代謝網(wǎng)絡(luò)尤為復(fù)雜。現(xiàn)在多數(shù)信號通路的研究都是集中在代謝網(wǎng)絡(luò)的一個很小的領(lǐng)域?；蚪M學(xué)、蛋白組學(xué)研究雖然已經(jīng)揭示了部分調(diào)節(jié)通路，但是和代謝網(wǎng)絡(luò)直接相關(guān)的是代謝產(chǎn)物。從茫茫多的代謝產(chǎn)物中選取研究對象，無疑是大海撈針。非靶向性代謝組學(xué)又稱為發(fā)現(xiàn)代謝組學(xué)，主要是將對照組和實驗組的代謝組（某一生物體的全部代謝物）進行比對，以找出其代謝物的差異。

　　

　　非靶向代謝組學(xué)流程中，第一步對樣品進行前處理，提取代謝物；之后使用MS或者NMR對這些代謝物進行檢測獲取原始數(shù)據(jù)；原始數(shù)據(jù)經(jīng)過數(shù)據(jù)處理之后轉(zhuǎn)換成可供下一步數(shù)據(jù)分析的數(shù)據(jù)矩陣，通常在這個數(shù)據(jù)集中行數(shù)對應(yīng)樣本的個數(shù)，列數(shù)對應(yīng)變量（代謝物信號）的個數(shù)。接著，對數(shù)據(jù)集進行數(shù)據(jù)分析包括數(shù)據(jù)前處理和具體的分析，最終獲得代謝標記物。